arrow_back
Retour aux plateformes

GenOuest : Plateforme de bio-informatique de Rennes

GenOuest

Description

Description de la plateforme

Hébergée au sein d'un Institut de Recherche en Informatique, la plateforme GenOuest offre l'accès à un environnement bio-informatique complet combinant une infrastructure matérielle et logicielle, des bases de données publiques, des outils et chaînes de traitements, le support associé. Cet environnement de calcul est exploitable de diverses façons : cluster, cloud privé, portail web.

Grâce au projet CeSGO, GenOuest propose un ensemble d'outils collaboratifs pour gérer au mieux les projets et données scientifiques. GenOuest propose le développement d'applications bio-informatiques ainsi qu'une expertise et des formations. Elle assure également le transfert technologique des nouveaux outils issus de la recherche en bio- informatique de l'Institut dont elle dépend.
La plateforme GenOuest est membre de l'Institut Français de Bioinformatique (IFB)

Plateforme Biogenouest.


Pôles de recherche

Mathématiques-Numérique

Thématique scientifique principale

Biologie, Santé, Agronomie, Alimentation

Thématique(s) scientifique(s) secondaires

Biologie, Santé, Agronomie, Alimentation
Sciences du numérique et mathématiques

Mots clés

bioinformatique, iaas, infrastructure, calcul haute performance, banques de données, développement logiciel, iso 9001, développement logiciel, analyse de données, gestion de données, bases de données, calcul scientifique, Cloud computing, e-infrastructure, Environnement Virtuel de Recherche, formation


Certification(s)

  • AFNOR ISO 9001

Compétences

Compétences / Expertises

Analyses omiques
Gestion des données et de la connaissance, IA, bioinformatique

Équipements et ressources

Équipements

Centre de calculs/Data center

Détails des équipements

Cluster de calcul (700 coeurs, 6 To RAM)
Cluster Docker (120 coeurs, 640 Go RAM)
Cloud privé (300 coeurs, 1,5 To RAM)
Cluster GPU (4 Nvidia Tesla V100, 2560 Tensor cores, 20480 CUDA cores)
Stockage 2 Po


Services

Services

  • Prestations de service
  • Collaboration de R&D
  • Mise à disposition
  • Formation

Offres de services

Mise à disposition d'environnements pour la gestion et l'analyse des données Biologiques et Biomédicales.
Technologies de l'information et de la communication appliquées à la Biologie.
Développement d'outils et de méthodes pour la bio-informatique.
Formations aux outils et technologies.
Développement d'outils et de méthodes pour la bio-informatique.
Développement de bases de données et de ressources pour la Biologie, Analyse de données, Technologies de l'information et de la communication appliquées à la Biologie.
Formation en bio-informatique.


Modalités d'accès à la plateforme

Pour les académiques création d'un compte sur https://my.genouest.org


Public concerné par les services

  • Interne
  • Académiques
  • Entreprises, administrations, associations

Réalisations

Projets

La plate-forme GenOuest porte le CPER CeSGO (https://www.cesgo.org) qui propose un environnement pour la gestion des projets et des données scientifiques. Cet environnement offre un espace collaboratif en lien avec les données qui permet aux scientifiques d'adopter les pratiques des FAIR data.

En terme de développements, la plate-forme GenOuest gère plusieurs projets avec, par exemple, l'outil BioMAJ (https://biomaj.genouest.org) qui permet de faciliter la gestion des données de référence.

On peut également citer l'outil Go-Docker (https://godocker.genouest.org), qui offre un environnement de gestion de tâches de calcul avec Docker. Les développements se font en Open source et sont disponibles.

Ecosystème

Établissement principal

Etablissement universitaire - Université de Rennes


Établissement(s) secondaire(s)

  • Institut CNRS - INRIA

Labellisation

  • IBiSA
  • IFB

Contact
NICOLAS Jacques (Responsable scientifique)
Site internet
Adresse
263 avenue du Général Leclerc
Campus de Beaulieu - Irisa-Inria
RENNES
Suggérer une modification
Vous souhaitez effectuer une demande de modification des informations liées à cette entité ? Renseignez les champs concernés dans le formulaire ci-après.
Université de Rennes
Contactez-nous

Université de Rennes
Direction de la recherche et de l’innovation
2 rue du Thabor
CS 46510
35065 Rennes cedex

Privacy Preference Center